**************************************************************************** CEHS base-pair parameters bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 6.90 -17.33 -0.60 2 G-C -0.24 -0.18 0.49 9.32 -14.34 -2.06 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.43 -5.41 0.43 4 G-C -0.26 -0.11 0.01 10.79 -9.48 1.01 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.71 -15.32 1.59 6 A-T 0.05 -0.05 0.06 0.44 -15.02 6.18 7 T-A -0.04 -0.12 0.17 -0.26 -16.75 3.89 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.56 -16.38 5.07 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.39 -10.32 -1.21 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.20 -9.61 3.19 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.73 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.67 -4.96 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.11 0.14 1.89 -12.69 1.18 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.37 4.55 2.83 **************************************************************************** CEHS base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.08 0.04 3.20 -3.11 8.62 32.75 2 GC/GC 0.50 0.67 3.69 2.68 -9.05 43.54 3 CG/CG -0.14 0.59 3.00 0.96 11.26 25.39 4 GA/TC -0.45 -0.14 3.39 -1.63 1.34 37.44 5 AA/TT 0.17 -0.34 3.30 -0.61 0.30 37.38 6 AT/AT -0.01 -0.62 3.22 -0.19 -2.86 32.36 7 TT/AA -0.08 -0.41 3.21 1.60 -1.15 33.69 8 TC/GA -0.27 -0.23 3.46 1.09 -1.84 41.91 9 CG/CG 0.70 0.77 3.07 -3.83 4.16 26.96 10 GC/GC -1.31 0.36 3.37 -2.60 -9.34 41.52 11 CG/CG -0.31 0.22 3.17 -0.77 6.76 33.34 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.08 3.28 -0.58 0.74 35.12 s.d. 0.53 0.47 0.19 2.07 6.65 5.90 **************************************************************************** CompDNA base-pair parameters bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 6.82 -17.33 -0.60 2 G-C -0.24 -0.18 0.49 9.24 -14.33 -2.07 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.43 -5.41 0.43 4 G-C -0.26 -0.11 0.01 10.76 -9.48 1.01 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.67 -15.32 1.59 6 A-T 0.05 -0.05 0.07 0.44 -15.00 6.18 7 T-A -0.04 -0.12 0.17 -0.26 -16.74 3.89 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.54 -16.37 5.07 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.34 -10.31 -1.23 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.19 -9.61 3.20 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.73 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.67 -4.96 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.11 0.14 1.87 -12.69 1.18 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.33 4.54 2.83 **************************************************************************** CompDNA base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.09 0.04 3.20 -3.16 8.54 32.69 2 GC/GC 0.50 0.67 3.69 2.82 -9.06 43.42 3 CG/CG -0.14 0.59 3.00 0.98 11.30 25.27 4 GA/TC -0.45 -0.14 3.39 -1.58 1.38 37.43 5 AA/TT 0.17 -0.33 3.30 -0.33 0.46 37.38 6 AT/AT -0.01 -0.60 3.22 -0.31 -2.67 32.37 7 TT/AA -0.08 -0.40 3.22 1.68 -0.97 33.70 8 TC/GA -0.27 -0.23 3.47 0.69 -1.68 41.91 9 CG/CG 0.70 0.78 3.07 -3.66 4.18 26.94 10 GC/GC -1.31 0.36 3.37 -2.85 -9.37 41.41 11 CG/CG -0.31 0.21 3.17 -0.67 6.69 33.30 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.09 3.28 -0.58 0.80 35.07 s.d. 0.53 0.47 0.19 2.08 6.62 5.90 **************************************************************************** Curves base-pair parameters (by Xiang-Jun Lu) bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 7.06 -17.27 -0.61 2 G-C -0.24 -0.18 0.50 9.46 -14.24 -2.08 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.44 -5.40 0.43 4 G-C -0.25 -0.12 0.01 10.87 -9.39 1.01 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.79 -15.30 1.60 6 A-T 0.05 -0.05 0.07 0.45 -15.00 6.23 7 T-A -0.04 -0.12 0.18 -0.27 -16.74 3.93 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.59 -16.36 5.12 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.49 -10.19 -1.22 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.23 -9.59 3.21 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.29 -17.42 -1.75 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.68 -4.95 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.12 0.14 1.92 -12.65 1.19 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.43 4.55 2.85 **************************************************************************** Curves base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.09 0.04 3.21 -3.27 8.50 32.70 2 GC/GC 0.49 0.67 3.70 2.88 -9.05 44.22 3 CG/CG -0.14 0.59 3.01 0.96 11.30 24.84 4 GA/TC -0.45 -0.14 3.39 -1.59 1.37 37.56 5 AA/TT 0.17 -0.32 3.30 -0.33 0.46 37.66 6 AT/AT -0.01 -0.60 3.22 -0.31 -2.67 32.43 7 TT/AA -0.08 -0.40 3.22 1.68 -0.97 33.79 8 TC/GA -0.27 -0.22 3.47 0.68 -1.69 42.36 9 CG/CG 0.70 0.78 3.07 -3.65 4.18 26.21 10 GC/GC -1.31 0.36 3.38 -2.86 -9.37 41.68 11 CG/CG -0.31 0.21 3.18 -0.68 6.69 33.27 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.09 3.29 -0.59 0.80 35.16 s.d. 0.53 0.47 0.19 2.10 6.62 6.28 **************************************************************************** FreeHelix base-pair parameters (by Xiang-Jun Lu) bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 6.90 -17.36 -0.60 2 G-C -0.24 -0.18 0.49 9.32 -14.38 -2.07 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.43 -5.41 0.43 4 G-C -0.26 -0.11 0.01 10.79 -9.52 1.01 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.71 -15.34 1.59 6 A-T 0.05 -0.05 0.07 0.44 -15.00 6.18 7 T-A -0.04 -0.12 0.17 -0.26 -16.74 3.89 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.56 -16.37 5.07 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.39 -10.38 -1.23 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.20 -9.61 3.20 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.73 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.67 -4.96 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.11 0.14 1.89 -12.71 1.18 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.37 4.54 2.83 **************************************************************************** FreeHelix base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.09 0.04 3.20 -3.17 8.54 32.69 2 GC/GC 0.50 0.67 3.69 2.82 -9.07 43.42 3 CG/CG -0.14 0.59 3.00 0.98 11.30 25.27 4 GA/TC -0.45 -0.14 3.39 -1.58 1.38 37.43 5 AA/TT 0.17 -0.33 3.30 -0.33 0.46 37.38 6 AT/AT -0.01 -0.60 3.22 -0.31 -2.67 32.37 7 TT/AA -0.08 -0.40 3.22 1.68 -0.97 33.70 8 TC/GA -0.27 -0.23 3.47 0.69 -1.68 41.91 9 CG/CG 0.70 0.78 3.07 -3.66 4.18 26.94 10 GC/GC -1.31 0.36 3.37 -2.86 -9.37 41.41 11 CG/CG -0.31 0.21 3.17 -0.67 6.69 33.30 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.09 3.28 -0.58 0.80 35.07 s.d. 0.53 0.47 0.19 2.08 6.62 5.90 **************************************************************************** NGEOM base-pair parameters bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 6.93 -17.31 -0.61 2 G-C -0.24 -0.18 0.49 9.34 -14.30 -2.08 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.43 -5.40 0.43 4 G-C -0.26 -0.11 0.01 10.81 -9.45 1.01 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.72 -15.31 1.60 6 A-T 0.05 -0.05 0.07 0.44 -15.00 6.23 7 T-A -0.04 -0.12 0.17 -0.26 -16.74 3.93 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.56 -16.36 5.12 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.41 -10.27 -1.22 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.21 -9.60 3.21 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.75 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.67 -4.95 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.12 0.14 1.89 -12.68 1.19 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.38 4.54 2.85 **************************************************************************** NGEOM base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.07 0.07 3.20 -3.22 8.52 32.73 2 GC/GC 0.51 0.61 3.70 2.85 -9.06 43.88 3 CG/CG -0.14 0.63 2.99 0.97 11.30 25.11 4 GA/TC -0.46 -0.13 3.39 -1.59 1.37 37.50 5 AA/TT 0.17 -0.32 3.30 -0.33 0.46 37.52 6 AT/AT -0.01 -0.61 3.22 -0.31 -2.67 32.40 7 TT/AA -0.07 -0.40 3.22 1.68 -0.97 33.74 8 TC/GA -0.26 -0.24 3.47 0.68 -1.69 42.14 9 CG/CG 0.69 0.79 3.07 -3.66 4.18 26.58 10 GC/GC -1.33 0.31 3.37 -2.85 -9.37 41.60 11 CG/CG -0.31 0.24 3.17 -0.68 6.69 33.31 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.09 3.28 -0.59 0.80 35.14 s.d. 0.53 0.47 0.20 2.09 6.62 6.09 **************************************************************************** NUPARM base-pair parameters bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.28 -0.14 0.07 6.90 -17.30 -0.60 2 G-C -0.24 -0.18 0.49 9.32 -14.29 -2.05 3 C-G 0.24 -0.17 0.16 -4.43 -5.40 0.43 4 G-C -0.25 -0.11 0.01 10.79 -9.44 1.00 5 A-T -0.04 -0.11 0.01 4.71 -15.31 1.59 6 A-T 0.05 -0.05 0.06 0.44 -15.02 6.18 7 T-A -0.04 -0.12 0.17 -0.26 -16.75 3.89 8 T-A -0.11 -0.12 -0.00 -1.56 -16.38 5.07 9 C-G 0.21 -0.13 0.00 -12.39 -10.25 -1.21 10 G-C -0.11 -0.05 0.24 4.20 -9.60 3.19 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.73 12 G-C -0.24 -0.07 0.25 4.67 -4.95 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.11 0.14 1.89 -12.68 1.18 s.d. 0.19 0.04 0.15 6.37 4.55 2.83 **************************************************************************** NUPARM base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.06 0.11 3.20 -3.25 8.98 32.64 2 GC/GC 0.53 0.55 3.70 2.87 -9.77 43.39 3 CG/CG -0.13 0.66 2.99 0.98 11.51 25.27 4 GA/TC -0.47 -0.13 3.39 -1.71 1.41 37.43 5 AA/TT 0.17 -0.34 3.30 -0.63 0.33 37.38 6 AT/AT -0.01 -0.64 3.21 -0.20 -2.97 32.35 7 TT/AA -0.07 -0.42 3.21 1.67 -1.19 33.69 8 TC/GA -0.26 -0.26 3.46 1.17 -2.03 41.90 9 CG/CG 0.68 0.80 3.07 -3.92 4.29 26.92 10 GC/GC -1.34 0.26 3.37 -2.77 -9.96 41.37 11 CG/CG -0.32 0.27 3.17 -0.81 7.07 33.28 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.11 0.08 3.28 -0.60 0.70 35.06 s.d. 0.53 0.47 0.20 2.17 6.98 5.89 **************************************************************************** NUPARM base-pair helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 CG/CG -1.33 -0.65 3.10 14.98 5.49 33.98 2 GC/GC 1.85 -0.40 3.53 -11.90 -3.57 44.48 3 CG/CG -1.54 0.54 2.99 24.55 -1.92 27.85 4 GA/TC -0.40 0.48 3.40 2.08 2.53 37.49 5 AA/TT -0.57 -0.35 3.29 0.49 0.94 37.39 6 AT/AT -0.62 -0.01 3.26 -5.10 0.34 32.48 7 TT/AA -0.54 0.40 3.22 -1.95 -2.75 33.75 8 TC/GA -0.12 0.50 3.46 -2.61 -1.51 41.96 9 CG/CG 0.68 -2.42 3.03 9.02 8.01 27.55 10 GC/GC 1.51 1.60 3.30 -12.87 3.54 42.57 11 CG/CG -0.71 0.42 3.17 11.67 1.34 34.01 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.16 0.01 3.25 2.58 1.13 35.78 s.d. 1.08 1.01 0.17 11.49 3.58 5.64 **************************************************************************** RNA base-pair parameters bp Shear Stretch Stagger Buckle Propeller Opening 1 C-G 0.26 -0.15 0.07 6.93 -17.31 -0.60 2 G-C -0.25 -0.19 0.50 9.34 -14.30 -2.06 3 C-G 0.25 -0.17 0.16 -4.43 -5.40 0.43 4 G-C -0.27 -0.13 0.01 10.81 -9.45 1.01 5 A-T -0.05 -0.11 0.01 4.72 -15.31 1.59 6 A-T 0.05 -0.06 0.05 0.44 -15.01 6.20 7 T-A -0.04 -0.12 0.16 -0.26 -16.75 3.90 8 T-A -0.10 -0.12 -0.02 -1.56 -16.37 5.08 9 C-G 0.23 -0.15 0.00 -12.41 -10.27 -1.21 10 G-C -0.11 -0.06 0.23 4.21 -9.60 3.20 11 C-G 0.16 -0.13 0.21 0.28 -17.42 -1.74 12 G-C -0.25 -0.07 0.25 4.67 -4.95 -1.62 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.01 -0.12 0.14 1.89 -12.68 1.18 s.d. 0.20 0.04 0.15 6.38 4.55 2.84 **************************************************************************** RNA base-pair step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 CG/CG 0.11 0.09 3.23 -3.23 8.69 32.65 2 GC/GC 0.47 0.62 3.48 2.83 -9.29 43.78 3 CG/CG -0.13 0.62 3.23 0.96 11.36 25.03 4 GA/TC -0.47 -0.14 3.29 -1.63 1.38 37.50 5 AA/TT 0.10 -0.37 3.23 -0.47 0.39 37.52 6 AT/AT 0.02 -0.67 3.20 -0.26 -2.80 32.39 7 TT/AA -0.09 -0.45 3.19 1.66 -1.07 33.74 8 TC/GA -0.17 -0.26 3.29 0.91 -1.83 42.13 9 CG/CG 0.62 0.78 3.33 -3.77 4.21 26.56 10 GC/GC -1.26 0.30 3.31 -2.78 -9.55 41.50 11 CG/CG -0.31 0.26 3.24 -0.74 6.83 33.27 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 0.07 3.28 -0.59 0.76 35.10 s.d. 0.50 0.49 0.08 2.11 6.74 6.08 **************************************************************************** RNA base-pair helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 CG/CG -1.26 -0.72 3.12 14.86 5.53 33.94 2 GC/GC 1.75 -0.33 3.30 -11.97 -3.65 44.85 3 CG/CG -1.61 0.53 3.20 24.39 -2.07 27.51 4 GA/TC -0.41 0.50 3.30 2.11 2.49 37.56 5 AA/TT -0.63 -0.22 3.23 0.60 0.72 37.53 6 AT/AT -0.69 -0.08 3.24 -4.94 0.45 32.51 7 TT/AA -0.60 0.43 3.20 -1.81 -2.82 33.80 8 TC/GA -0.16 0.33 3.30 -2.49 -1.23 42.18 9 CG/CG 0.55 -2.30 3.29 8.95 8.01 27.16 10 GC/GC 1.44 1.43 3.23 -12.94 3.76 42.67 11 CG/CG -0.68 0.41 3.23 11.60 1.26 33.97 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.21 -0.00 3.24 2.58 1.13 35.79 s.d. 1.05 0.95 0.06 11.43 3.61 5.84 **************************************************************************** Strand I base step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 C/G -0.62 0.31 3.45 2.23 12.42 31.25 2 G/C -0.27 0.67 3.43 0.17 -4.12 45.00 3 C/G -0.94 0.74 3.23 10.12 10.04 24.68 4 G/A -1.11 0.07 3.40 -0.48 1.12 37.82 5 A/A -0.55 -0.24 3.35 2.61 1.38 39.66 6 A/T -0.58 -0.65 3.36 3.66 -3.70 31.01 7 T/T -0.69 -0.47 3.28 5.87 -1.30 33.77 8 T/C -0.85 -0.45 3.44 0.38 -1.38 38.79 9 C/G -0.08 0.72 3.37 6.82 3.54 28.79 10 G/C -1.99 0.38 3.47 0.06 -12.46 39.46 11 C/G -1.19 0.30 3.36 4.48 13.63 32.98 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.81 0.12 3.38 3.26 1.74 34.84 s.d. 0.51 0.51 0.07 3.34 7.83 5.87 **************************************************************************** Strand I base helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 C/G -1.69 -0.34 3.27 21.64 -3.89 33.71 2 G/C 1.27 -1.44 3.36 -5.23 -0.21 45.19 3 C/G -0.78 2.40 2.72 21.14 -21.31 28.50 4 G/A -0.05 -0.16 3.41 1.69 0.73 37.84 5 A/A -0.53 -0.68 3.30 1.99 -3.76 39.77 6 A/T -0.48 -0.02 3.32 -6.77 -6.69 31.44 7 T/T -0.58 0.30 3.13 -2.19 -9.86 34.31 8 T/C -0.50 -0.48 3.45 -2.04 -0.57 38.82 9 C/G 0.61 -0.13 3.33 6.89 -13.26 29.79 10 G/C 2.00 1.02 3.19 -17.53 -0.08 41.38 11 C/G -1.57 0.79 3.05 22.33 -7.34 35.97 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.21 0.11 3.23 3.81 -6.02 36.06 s.d. 1.12 1.01 0.21 13.03 6.76 5.12 **************************************************************************** Strand II base step parameters step Shift Slide Rise Tilt Roll Twist 1 G/C 0.87 -0.13 3.27 -8.87 4.97 33.03 2 C/G 1.19 0.56 3.71 5.56 -14.48 42.74 3 G/C 0.67 0.51 3.34 -8.20 12.63 24.88 4 C/T 0.18 -0.34 3.36 -2.75 1.66 37.07 5 T/T 0.76 -0.44 3.35 -3.20 -0.64 34.96 6 T/A 0.63 -0.61 3.27 -4.36 -2.09 33.21 7 A/A 0.49 -0.37 3.34 -2.50 -1.00 33.09 8 A/G 0.52 -0.04 3.36 1.01 -2.05 45.53 9 G/C 1.32 0.85 3.42 -14.14 4.71 23.47 10 C/G -0.53 0.23 3.37 -5.87 -6.70 43.25 11 G/C 0.57 0.18 3.31 -6.06 0.11 32.94 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. 0.61 0.04 3.37 -4.49 -0.26 34.93 s.d. 0.49 0.47 0.12 5.20 6.88 7.02 **************************************************************************** Strand II base helical parameters step X-disp Y-disp h-Rise Incl. Tip h-Twist 1 G/C -0.98 -1.01 2.88 8.37 14.92 34.56 2 C/G 2.25 0.85 3.45 -18.62 -7.15 45.46 3 G/C -1.89 -1.41 2.89 26.16 16.99 29.09 4 C/T -0.77 1.14 3.32 2.55 4.23 37.21 5 T/T -0.62 0.04 3.27 -1.04 5.22 35.12 6 T/A -0.70 -0.01 3.19 -3.57 7.47 33.56 7 A/A -0.47 0.51 3.30 -1.73 4.33 33.20 8 A/G 0.14 1.24 3.36 -2.57 -1.26 45.58 9 G/C 0.66 -4.25 2.36 10.24 30.75 27.80 10 C/G 0.99 1.92 3.33 -8.75 7.66 44.16 11 G/C 0.30 -0.20 3.15 0.18 10.42 33.49 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ave. -0.10 -0.11 3.14 1.02 8.51 36.29 s.d. 1.13 1.69 0.32 11.41 10.00 6.22